Genepidgin ist eine Sammlung von Python-Tools, die bei der Bewertung und Zuordnung Genprodukt Namen unterstützen & nbsp; Es gibt drei Hauptkomponenten.:genepidgin * Reiniger *& Nbsp; standardisiert Gennamen pro UNIPROT Benennungsrichtliniengenepidgin *...
STEPS ist ein Paket für die exakte stochastische Simulation von Reaktions-Diffusions-Systeme in beliebig komplexe 3D-Geometrien. Unsere Kernsimulationsalgorithmus ist eine Implementierung Gille SSA, verlängert, um mit der Diffusion von Molekülen über die...
TRMiner ist ein Python-Programm, das auf wissenschaftlichen Daten Kuratoren soll. & Nbsp; Es ermöglicht, schnell zu beschneiden große Sammlungen von wissenschaftlichen Publikationen, um für eine bestimmte Bergbau Ziel entsprechenden Sätze.Dies wird in...
Die Bioinformatics Benchmark-System ist ein Versuch, einen vernünftigen Test-Framework, Tests und Daten aufbauen, um Endkunden und Anbietern zu ermöglichen, die Leistung ihrer Systeme zu untersuchen.Was wir versuchen zu tun, ist es, einen Rahmen für die...
Staden-Paket ist eine vollständig entwickelte Reihe von DNA-Sequenz Montage (GAP4), Bearbeitung und Analyse-Tools (Spin) für Unix, Linux, Mac OS X und MS Windows.Auf der Vorderseite GAP4 gab es mehrere kleinere Füge verwandtenVerbesserungen, wie es...
AREM wird ein (für ChIP-Seq Daten Model Based Analysis) basierend auf MACS.Hochdurchsatz-Sequenzierung an Chromatin Immunniederschlag (ChIP-Seq) gekoppelt ist weit verbreitet in der Charakterisierung von genomweiten Bindungsmuster von...
seriesoftubes ist eine erweiterte Pipeline für Solexa ChIP-Seq Daten.Package Dokumentation Anforderungen : ...
MetagenomeDB ist eine Python-Bibliothek entwickelt, um einfach zu speichern, abzurufen und mit Anmerkungen versehen Metagenom-Sequenzen. & Nbsp; MetagenomeDB wirken als eine Abstraktionsschicht auf einem MongoDB-Datenbank. Es bietet eine API, um zwei...
Seal ist ein Python-Modul, das Sequenz-Alignment bietet auf Hadoop.Dichtung eine von MapReduce Anwendung für biologische Sequenzausrichtung. Es läuft auf Hadoop (http://hadoop.apache.org) durch Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), ein Python-MapReduce...
MISO (Gemisch von Isoformen) ist eine probabilistische Rahmen in Python geschrieben, die das Expressionsniveau & nbsp quantifiziert, der alternativ gespleißten Genen RNA-Seq Daten und identifiziert differentiell regulierten Isoformen oder Exons in...
