Beste Bioinformatik Für Linux
Build Systemen wie Make werden häufig verwendet, um komplizierte Arbeitsabläufe, zum Beispiel zu erstellen in der Bioinformatik. & nbsp; snakemake zielt darauf ab, die Komplexität der Erstellung von Workflows, indem sie eine saubere und moderne...
CLC DNA Workbench erstellt eine Software-Umgebung ermöglicht Benutzern, eine große Anzahl von fortgeschrittenen DNA-Sequenz-Analysen machen, kombiniert mit glatten Datenmanagement und exzellente grafische Anzeige und Ausgabeoptionen.CLC DNA Workbench ist...
seriesoftubes ist eine erweiterte Pipeline für Solexa ChIP-Seq Daten.Package Dokumentation
Anforderungen :
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Die STEME Projekt begann als eine Annäherung an die Erwartung-Maximierungsalgorithmus für die Art des Modells in Motiv Findern wie MEME verwendet.STEME & rsquo; s EM Annäherung läuft eine Größenordnung schneller als die MEME Umsetzung für typische...
Genepidgin ist eine Sammlung von Python-Tools, die bei der Bewertung und Zuordnung Genprodukt Namen unterstützen & nbsp; Es gibt drei Hauptkomponenten.:genepidgin * Reiniger *& Nbsp; standardisiert Gennamen pro UNIPROT Benennungsrichtliniengenepidgin *...
MISO (Gemisch von Isoformen) ist eine probabilistische Rahmen in Python geschrieben, die das Expressionsniveau & nbsp quantifiziert, der alternativ gespleißten Genen RNA-Seq Daten und identifiziert differentiell regulierten Isoformen oder Exons in...
Pathomx (früher MetaPath) ist ein Open-Source-Grafiksoftware in IPython, Qt und PyQt umgesetzt, von Grund auf entwickelt, um als interaktives Dienstprogramm für die Visualisierung und Analyse von Stoffwechseldaten unter GNU / Linux und andere POSIX & nbsp...
Burrows-Wheeler Aligner (BWA) ist ein leistungsfähiges Programm, das verhältnismäßig kurze Nukleotidsequenzen gegen eine lange Referenzsequenz richtet wie das menschliche Genom.Die Software implementiert zwei Algorithmen, BWA-kurzen und BWA-SW. Die...
avalanchetoolbox ist eine Toolbox für die Identifizierung und die Verzweigung Prozesse, wie neuronale Lawinen beschreiben Anforderungen . ...
OpenElectrophy ist ein Rahmen zur Manipulation, Speicherung und Analyse der elektrophysiologischen Daten zu erleichtern. Es kann Daten aus vielen verschiedenen Dateiformaten importieren und speichern sie in einer einzigen...