MISO (Gemisch von Isoformen) ist eine probabilistische Rahmen in Python geschrieben, die das Expressionsniveau & nbsp quantifiziert, der alternativ gespleißten Genen RNA-Seq Daten und identifiziert differentiell regulierten Isoformen oder Exons in Proben.
Durch die Modellierung der generativen Verfahren, mit dem aus Isoformen in RNA-Seq hergestellt liest, verwendet der MISO-Modell Bayes-Inferenz, um die Wahrscheinlichkeit, dass ein Lese stammt aus einer bestimmten Isoform zu berechnen.
MISO verwendet die abgeleitete Zuordnung liest Isoformen, die Häufigkeiten der zugrunde liegenden Satz alternativer mRNA-Isoformen zu quantifizieren. Konfidenzintervalle über Schätzungen erhalten werden, was die Zuverlässigkeit der Schätzungen beziffern.
Bitte beachten Sie http://genes.mit.edu/burgelab/miso/docs/ für MISO Handbuch und Dokumentation
Anforderungen .
- Python
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