STEPS ist ein Paket für die exakte stochastische Simulation von Reaktions-Diffusions-Systeme in beliebig komplexe 3D-Geometrien. Unsere Kernsimulationsalgorithmus ist eine Implementierung Gille SSA, verlängert, um mit der Diffusion von Molekülen über die...
Tapir ist ein Python-Tool, mit Programmen zu schätzen und zu plotten phylogenetische Aussage für große Datenmengen enthält. Unter Berufung Tapir Bitte bei der Verwendung von Tapir, zitieren:- Faircloth BC, Chang J, Alfaro ME: Tapir ermöglicht...
PicMe ist ein Python-Paket, Programme zu schätzen und zu plotten phylogenetische Aussage für große Datenmengen enthält. Installation Für den Moment ist der einfachste Weg, um das Programm zu installieren:git clone git: //github.com/faircloth-lab/picme.git...
tigreBrowser ist eine Genexpression Modellbrowser für Ergebnisse aus tigre R-Paket (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/tigre.html). Installation: tigreBrowser erfordert Python-Version> = 2.5. tigreBrowser kann mit dem folgenden Befehl...
checkmyclones ist eine Software, Tools bietet, um Sanger-Sequenzierung Ergebnisse & nbsp prüfen;. (Oder ein Klartext oder fastq Dateien) mit einem Satz von Referenzsequenzen, in jeder angemessenen Form (einschließlich Koordinaten) versehen ...
Syntainia ist eine innovative Anwendung zur Visualisierung mehrerer Genome & nbsp;. Es stellt eine einfache und intuitive Benutzerschnittstelle anzeigen und bearbeiten Beziehungen zwischen Gruppen von Genen. Mit einer klareren Gen Visualisierung, ist es...
CWC Simulator ist ein C ++ Implementierung der CWC, einem Kalkül für die Darstellung und Simulation biologischer Systeme & nbsp;. Nach erfolgreicher Installation (siehe INSTALL) werden Sie in der Lage, Simulationen über CWC Modelle laufen, wie in einigen...
AREM wird ein (für ChIP-Seq Daten Model Based Analysis) basierend auf MACS.Hochdurchsatz-Sequenzierung an Chromatin Immunniederschlag (ChIP-Seq) gekoppelt ist weit verbreitet in der Charakterisierung von genomweiten Bindungsmuster von...
AHREA ist ein Sofware-Suite, die die Suche nach Relative Expression Lernenden einfach macht. . Es ist in Python geschrieben Anforderungen : ...
E-Cell System ist ein Konzept zur Konstruktion virtuellen Zellen auf Computern.E-Cell System ist eine objektorientierte Software-Suite für die Modellierung, Simulation und Analyse von großen komplexen Systemen wie biologische Zellen, von Kouichi Takahashi...
