LSim lagert makromolekularen Elektronendichten und berechnet eine strukturelle Ähnlichkeit Punktzahl. Seine Berechnungen maßstäblich linear mit der Größe der Moleküle verglichen.
Die LSim Ausrichtungen sind konzeptionell nicht mit biochemischen Strukturelemente und sind daher unvoreingenommene und angemessen für Struktur-only-Protein Ähnlichkeit Studien.
Installation:
Entpacken Sie die Distribution-Datei:
tar -xzvf lsim-linux.tar.gz
Gehen Sie zu Datei-Verzeichnis:
cd lsim.1.0.0
Kopieren, verschieben oder verknüpfen Sie die ausführbare Datei lsim an einem geeigneten Ort -und sicherstellen lsim ist durch die PATH-Umgebungs variabel, beispielsweise zugänglich:
cp lsim / usr / local / bin
Variable setzen LSIMDIR, um zur gewählten LSim Verzeichnis, zB Punkt:
setenv LSIMDIR /home/olaguer/progs/lsim.1.0.0
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