Muss Bioinformatik Für Linux
ProteinShop ist ein interaktives Werkzeug für die Manipulation von Proteinstrukturen. Es wurde entwickelt, um eine Reihe von Protein-Konfigurationen mit menschlichen Erkenntnis und Intuition schnell erstellen. Diese Konfigurationen können auf lokale oder...
pyNetConv ist eine Python-Bibliothek erstellt, um die Umwandlung von einigen Netzwerkdateiformate helfen.Seit Version 0.6 ist in der Lage pyNetConv Lese- / Schreibzugriff (und konvertieren von / bis) die folgenden...
Pysam ist ein Python-Modul zum Lesen und Bearbeiten von Samfiles. & Nbsp; Es ist ein leichtes Umhüllung der samtools C-API.Die Kurzanleitung finden Sie hier. Weitere ausführliche Dokumentation finden Sie hier.Fragen und Kommentare sind sehr willkommen und...
PySCeS ist ein Projekt von Triple-J Gruppe für Molekulare Zellphysiologie & nbsp entwickelt;., Um Modell zu versuchen und zu verstehen, die komplexen Prozesse und Systeme, die den lebenden Zelle Eigenschaften . Eine textbasierte...
reciprocal_smallest_distance ist eine paarweise Orthologie-Algorithmus, der globale Sequenzanordnung und Maximum-Likelihood-evolutionäre Distanz zwischen Sequenzen genau Orthologe zwischen Genomen erkennt verwendet. Installation von einem Tarball...
RFLP Planer ist ein Werkzeug, um eine RFLP Versuchsplan hilft: Es findet Restriktionsenzyme, die eine Reihe von Homolog-DNA-Sequenzen, die in unterschiedlicher Weise geschnitten und simuliert das resultierende Bild Gel- Elektrophorese. Das Programm hilft...
Seal ist ein Python-Modul, das Sequenz-Alignment bietet auf Hadoop.Dichtung eine von MapReduce Anwendung für biologische Sequenzausrichtung. Es läuft auf Hadoop (http://hadoop.apache.org) durch Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), ein Python-MapReduce...
seriesoftubes ist eine erweiterte Pipeline für Solexa ChIP-Seq Daten.Package Dokumentation
Anforderungen :
...
Build Systemen wie Make werden häufig verwendet, um komplizierte Arbeitsabläufe, zum Beispiel zu erstellen in der Bioinformatik. & nbsp; snakemake zielt darauf ab, die Komplexität der Erstellung von Workflows, indem sie eine saubere und moderne...
SSuMMo ist eine Bibliothek von Funktionen, um iterativ entwickelt, mit hmmer um Sequenzen zu Taxa zuzuordnen. & Nbsp; Die Ergebnisse sind sehr annotiert, die Art / Gattung Verteilung innerhalb dieser Gemeinschaft.Programme mit dem Quellcode enthalten sind...