MACS2 ist ein Modell basierte Analyse-Tool für ChIP-Seq Daten.
Mit der Verbesserung der Sequenzierungstechniken, gefolgt Chromatinimmunpräzipitation von Hochdurchsatz-Sequenzierung (ChIP-Seq) wird immer beliebter, um genomweite DNA-Protein-Wechselwirkungen zu untersuchen. Um den Mangel an leistungsfähigen ChIP-Seq Analysemethode anzugehen, stellen wir eine neue Algorithmus namens Modellbasierte Analyse ChIP-Seq (MACS) zur Identifizierung Transkript Faktor-Bindungsstellen. MACS erfasst den Einfluß Genom Komplexität, um die Signifikanz von angereichertem Chipbereiche auswerten und MACS verbessert die räumliche Auflösung der Bindungsstellen durch Kombination der Information von sowohl Sequenzierung tag Position und Orientierung. . MACS kann leicht für ChIP-Seq Daten allein verwendet werden, oder mit der Kontrollprobe mit der Erhöhung der Spezifität
Anforderungen :
- Python
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