CLC DNA Workbench

CLC DNA Workbench erstellt eine Software-Umgebung ermöglicht Benutzern, eine große Anzahl von fortgeschrittenen DNA-Sequenz-Analysen machen, kombiniert mit glatten Datenmanagement und exzellente grafische Anzeige und Ausgabeoptionen.
CLC DNA Workbench ist unter Windows, Mac OS X und Linux-Plattformen verfügbar

Eigenschaften .

• Bioinformatik bietet in Gene Workbench :
• Flexible Anzeige von kreisförmigen Molekülen.
• Editor zur grafischen und algorithmisch fortgeschrittene Primer-Design
• Montage von DNA-Sequenzdaten
• Molekulare Klonierung
• Automatische Annotation von SNP-Sequenzen
• Suche und Entdeckung der DNA-Muster
• Local Komplexität Region analysiert
• Rückübersetzung von Protein-Gen, auf Basis von Übersetzungstabellen aus einer Reihe von Arten
• Erweiterte Restriktionsenzym-Analyse und Management
• Dot Plot basiert Analysen
• Kurzform DNA Statistiken darunter eine Reihe von charakteristischen Eigenschaften eines bestimmten Moleküls
• NCBI-Sequenzdaten Suche
• Der Zugang zu Web-Informationen aus PubMed
• Andere Bioinformatik Features:
• DNA, RNA und Proteinsequenz-Editor die Anzeige sowohl linear als auch kreisförmige Moleküle
• DNA, RNA und Protein-Alignment-Editor
• Interaktive Logos auf beiden DNA, RNA und Protein Ausrichtungen
• Die Stapelverarbeitung von Analysen auf mehrere Sequenzen in einem Arbeitsschritt
• Motivsuche
• Pattern Entdeckung (unbekannte Muster)

Option
• Erweiterte Neuausrichtung und fixieren Punktausrichtung
• Sequence logo Graphen entlang DNA, RNA und Protein-Alignments
• manuelle Annotation von Sequenzen
• Integrierte PubMed Suche
• Web-basierten Sequenzsuche mit BLAST
• Dot Plot basiert Analysen
• Local Komplexität Region analysiert und Komplexität Grundstücke
• Gap Bruch Grafiken
• G / C-Content-Analyse und Grafiken
• Projekt- und Datenmanagement:
• Die vollständige Integration der Dateneingabe, Datenmanagement, Berechnungsergebnissen und Datenexport
• Detaillierte Verlaufsprotokoll
• Alle Arten von Dateien können in lokale Projekte gespeichert werden, und aus dem Programm ins Leben gerufen
• Import und Export von Daten in einer Vielzahl von Dateiformaten
• Möglichkeit der Arbeit in verschiedenen Arbeitsbereichen aktiv zu einer Zeit, ermöglicht die gleichzeitige Arbeit an mehreren Projekten
• Import von Trace-Daten-Dateien und Qualität erzielt mit automatischen DNA sequening Maschinen mit Standard-Chromatogram Format, ABI-Formate und PHD-Format (PHRED)
• Viewing und Reporting:
• Erweiterte BLAST Ansicht
• Erweiterte Graphen sehen
• Erweiterte Histogrammansicht
• Erweiterte Punktdiagramm-Ansicht
• Wählen Sie Eigenschaften in Sequenzen und Alignments

Anforderungen :

• 256 MB RAM erforderlich
• 512 MB RAM empfohlen
• 1024 x 768 Display empfohlen

Einschränkungen :

• 4-Wochen voll funktionsfähige Demo