ZOOM Lite

ZOOM Lite ist ein Next-Generation-Sequenzierung Datenmapping und Visualisierungssoftware. Nutzer Eingangsreferenz Genome und Illumina / Solexa kurzen liest Dateien oder AB Einfarbig Raum liest Dateien in verschiedenen Formaten, wie zB * .fasta, * .fastq, * _seq.txt, * .csfasta usw. ZOOM gibt die Zuordnung Ergebnisse dieser Kurz liest auf der Referenzsequenz. ZOOM Lite hat eine schnelle und genaue Zuordnung Kernel basierend auf einer neu gestalteten mehrere voneinander Samen Theorie. Sowohl Single-End und Paired-End liest in verschiedenen Längen von 15 bp bis 240bp können behandelt werden. Eine beliebige Anzahl von Fehlanpassungen und einer Insertion / Deletion mit verschiedenen Längen zwischen den Lese- und den Zielbereich auf der Referenzsequenz erlaubt sind. Eindeutig zugeordnet Ergebnisse oder besten (Top N) Ergebnisse für jede Lese wird nach den minimalen Fehlanpassungen und indel Länge gemeldet werden. Qualitätsfaktoren werden verwendet, um Abbildungsgenauigkeit zu verbessern. Auf der Basis der Mapping-Kernel ermöglicht ZOOM Lite Nutzern lokale Lesedaten und Referenzsequenz Daten zu laden, wählen Sie richtigen Parameter, Prozess großer Datenmengen parallel bei den bis zu vier CPUs, überwachen die laufenden Aufgaben, die Mapping-Ergebnisse zu speichern, zeigen Sie die Graphen von Mapping-Ergebnisse und Ausgangszuordnung führt entweder .BED * oder * .GFF Dateiformate zur weiteren Vermessung mit dem UCSC Browser Titelinformationen. Mapping Ergebnisse können in jedem beliebigen Maßstab über eine gesamte Chromosom, um detaillierte Sequenzvergleiche betrachtet werden, von der Lesetiefe Graphen zwischen liest und der Referenzsequenz. Benutzer leicht auf Bereiche von Interesse navigieren einfach per Klicken und Ziehen oder Scrollen. ZOOM Lite ist ein Derivat des ZOOM-Studio-Software

Was ist neu in dieser Pressemitteilung:.

Version 1.5 enthält SAM Exportformat, Architektur anzupassen, besseren Code-Optimierung, kleiner Programm binäre Größe, und ein Upgrade dabase engining für eine bessere Leistung.