proTRAC

Protrac ist ein einzigartiges und praktisches Werkzeug für die probabilistische piRNA Cluster-Erkennung, Visualisierung und Analyse. Protrac zeigt höhere Empfindlichkeit und Selektivität im Vergleich zum bisher angewandten Methoden der Cluster-Erkennung. Die Bedeutung der wahrgenommenen Sequenz Lesetreffer Dichte Strang Bias, Menge loci entsprechend selten abgebildet Folge liest, Höhe der Loci mit T an Position 1 oder A an Position 10 und die Höhe der Loci innerhalb des typischen piRNA Längenbereich (26- 32nt) berücksichtigt werden. Die beobachteten Eigenschaften der Cluster Kandidaten werden im Lichte der gegebenen Datensatz ausgewertet und unterliegen einer Wahrscheinlichkeitsbewertungssystem.