Arabidopsis Motiv Scanner (AMS) ist eine Windows-Anwendung, die auf lokalen Computern ausgeführt wird. Es wurde Gen entwickelt, Netzwerke aufzubauen, indem die Positionen von cis-regulatorischen Elemente in der Modellpflanze Arabidopsis thaliana identifiziert und durch eine einfache Schnittstelle bieten zu bewerten und Gen-Beziehungen zu bewerten. Die wesentliche Neuerung ist die cis-regulatorische Element Positionen, NGS und DNA-Chip-Arrays Expressionsdaten, Arabidopsis Anmerkungen und Gen-Interaktionen für die Identifizierung von Gen-Netzwerken durch Transkriptionsfaktoren reguliert zu kombinieren. In Studien zur Transkription fokussierte Faktoren Funktion, verwendet die Software die Expressionsdaten und Bindungsstelle Motive in den regulativen Genregionen direkte Zielgene zu prognostizieren. Zusätzlich verwendet AMS DNA-Protein und proteinprotein Wechselwirkungsdaten, die die Identifizierung der Stoffwechselwege durch den Transkriptionsfaktor von Interesse reguliert zu erleichtern.
Kommentare nicht gefunden