SimSoup

SimSoup ist eine grafische Artificial Chemie-Simulator für Linux und Windows.
Das Programm ermöglicht eine Chemie in Bezug auf Molekültypen und die möglichen Wechselwirkungen zwischen ihnen definiert werden. Ein Simulationslauf beinhaltet die Einrichtung einer Anzahl von Molekülen verschiedener Molekültypen in einem Reaktor, und dann ermöglicht Interaktionen, um über einen Zeitraum von Zeit. Interaktionen, die in dem Reaktor auf einem graphischen Display angezeigt wird.
Die Motivation für die Entwicklung des Programms ist es, Untersuchungen über das Verhalten von Netzwerken zu ermöglichen, insbesondere in Bezug auf den Stoffwechsel erste "Theorien über den Ursprung des Lebens, obwohl das grundlegende Design der SimSoup unterstützt Modellierung von jedem Netzwerk, in dem Wechselwirkungen zwischen stattfinden kann Knoten.
Derzeit hat SimSoup Entwicklung Prototyp-Stadium erreicht.
Hier sind einige der wichtigsten Features von "SimSoup":
ย ท A Chemie: Inklusive Molekültypen und Interaktionstypen
ย ท einem Reaktor: In welchen Interaktionen finden zwischen den Molekülen der verschiedenen Arten
ย ท grafische Ansichten der Chemie und Reaktorstaat
ย ท Grafische Darstellung der Statistik Simulation, einschließlich: -
- Zeitreihen-Plots: Diese zeigen die Zeitreihe Verhalten einer Reihe von Variablen, wie die Simulationsläufe überwacht werden
- Manhattan Grundstück: Diese zeigt die Variabilität in der Zusammensetzung des Materials in dem Reaktor über die Zeit
ย ท Trackers und Zyklus-Erkennung (NEU): Diese ermöglichen Zyklen erfasst und überwacht werden
ย ท Massenerhaltung
ย ท Wärme & Thermodynamik (NEU): Reaktionsraten basieren auf Überlegungen von Energie und Thermodynamik basiert
ย ท Szenario Display: Eine Anzeige der aktuellen Szenario und Statusinformationen über die Fortschritte
ย ท Aktionsanforderungen (NEU): Es sind Ereignisse, die geplant ist, um Platz zu bestimmten Zeiten zu nehmen. Zum Beispiel kann eine Aktion Abfragen eingerichtet werden, um zu bewirken, ein Molekül eines bestimmten Typs in den Reaktor zugegeben werden,
ย ท Eingabeprozessor (NEU): Dies ermöglicht ein Simulationsszenario in einer Datei definiert und SimSoup geladen werden
ย ท Systemmonitor: Eine (teilweise verdeckt) Bildschirm - hauptsächlich zu Diagnosezwecken
ย ท Verbesserte Benutzeroberfläche komplett auf GTK basiert (NEW)
Bedarf:
ย ท GSL (GNU Scientific Library)
ย ท gtkmm (A C ++ Schnittstelle an das GTK + GUI-Bibliothek)
Was ist neu in dieser Version:
ย ท Trackers und Zykluserkennung: Diese ermöglichen Zyklen erfasst und überwacht werden
ย ท Wärme & Thermodynamik: Reaktionsraten basieren auf Überlegungen von Energie und Thermodynamik basiert
ย ท Aktionsanforderungen: Es sind Ereignisse, die geplant ist, um Platz zu bestimmten Zeiten zu nehmen. Zum Beispiel kann eine Aktion Abfragen eingerichtet werden, um zu bewirken, ein Molekül eines bestimmten Typs in den Reaktor zugegeben werden,
ย ท Eingangs Prozessor: Dies ermöglicht ein Simulationsszenario in einer Datei definiert und SimSoup geladen werden
ย ท Verbesserte Benutzeroberfläche komplett auf GTK basiert.