Bibliosphere Analysis Kit

BiblioSphere bietet eine einzigartige Kombination von Literatur-Bergbau und Pfadanalyse für Molekularbiologen interessieren Genregulation und biologischen Netzwerken.
 BiblioSphere Pathway Edition verwendet eine umfassende Datenbank mit individuell modellierten Beziehungen zwischen Genen, Proteinen, Komplexen, Zellen und Gewebe zusammen mit up-to-date-Text-Mining-Techniken für die automatische Wissensextraktion, damit Sie Ihre Daten an biologischer Netzwerke in verschiedenen biologischen Zusammenhängen verknüpfen.
 Verwenden BiblioSphere auf

• erweitern biologischen Netzwerken über kanonische Weg Informationen (regulatorische und metabolische)
• verschmelzen Ihre hohen Durchsatz Ergebnisse mit biologischen Kenntnisse und Sequenzanalysen feststellen
• führen kontext empfindlicher regulatorischer Pfadanalyse
• erzeugen Experiment spezifischen Weg Varianten
• Link Wege von Krankheitsmechanismen und Gene
• tun fortgeschrittenen experimentellen Design

Was ist neu in dieser Pressemitteilung:

Neue und erweiterte Datenquellen

• Genomatix Expert Kuratiert Gen-Gen- Relations:
   Genomatix derzeit das firmeneigene Wissensbasis von Experten kuratiert Daten auf die Genregulation in BiblioSphere integriert. Diese einzigartige Datenquelle addiert die Semantik der Gen-Gen-Beziehungen zu den dynamisch erzeugten BiblioSphere Gen Netzwerken, die Informationen wie "Gene A aktiviert die Transkription des Gens B" oder "A Gene physisch Gen B wechselwirkt".
  
• Signaltransduktionswegen:
   Teile der Gene Ontology relevant Signaltransduktion sowie Daten aus der Literatur zusammengestellt wurden zusammengefasst, um die Identifizierung der kanonischen Pfade auf die fokussierte Netz verbunden zu ermöglichen.
  
• Stoffwechselweg Verbände:
   Stoffwechselweg Verbände wurden integriert, um die Identifizierung relevanter zu Ihrem Satz von Genen Stoffwechselvorgänge zu ermöglichen.
  

• Spazierweg Ausblick mit Experten kuratiert Gen-Gen-Beziehungen
   Gene Gruppen in leicht verständlicher dynamisches Netzwerk Diagramme kombinieren Hand kuratiert Gen-Gen-Beziehungen mit den Daten aus automatischen Wissensextraktion abgeleitet zusammengestellt. Netzwerke können durch Filter angepasst werden und konzentrierte sich in einem Gen zentriert Weg kürzester Weg Analyse durchzuführen.
  
• Zelluläre Lokalisierung anzeigen
   Basierend auf GO Annotationen Gene ihrer subzellulären Ort als Diagramm dargestellt Zellen-Layout zugeordnet und visualisiert, so dass Sie subzellulären Regionen identifizieren und Fächer relevant für Ihre Gen-Set.
  

• Project Management: Verwalten Sie Ihre Analysen durch die Organisation sie in Projektordnern. Schneller Zugriff auf frühere Ergebnisse mit wenigen Mausklicks oder neue Suchanfragen bestehende Projekte.
  

• Verschiedene kleine Verbesserungen und Bugfixes

Anforderungen :

• Mac OS X 10.2 oder höher
• Java 1.4.1 (Update 1 wird empfohlen)
• Verbindung zum Internet
• a Genomatix Auswertung Konto (kostenlos)