SigInt Projekt ist ein Kommandozeilen-Software-Werkzeug, das benutzt werden kann, um Säugetierproteine / Gene, die spezifisch und signifikant mit einer Liste von Proteinen / Gene in Zusammenhang mit einem Hintergrund Säugetier signalome und Interaktom Netzwerken interagieren zu finden und Rang.
Die Eingaben in das Programm sind: (a) eine Liste der menschlichen Samen Entrez Gene Gen-Symbole, (b) ein Hintergrundnetze in SIG-Format, und (c) einen Namen für die Ausgabedatei (Webseiten-Dateinamen mit der Erweiterung htm ). SigInt gibt eine sortierte Liste von Genen / Proteinen, die mit Komponenten aus der Seed-Liste zusammenwirkt. Diese Komponenten werden durch einen z-Wert, der die Spezifität dieser Zwischenkomponenten, mit den Genen / Proteinen von der Seed-Liste in Wechselwirkung mißt sortiert.
SigInt auf Linux, Mac und Windows-Betriebssystemen ausgeführt werden und es eine Hintergrundnetz Textdatei im SIG-Format benötigt.
Verbrauch:
Entpacken Sie das Archiv
chmod + x sigint_lnx.exe
./sigint_lnx.exe
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