POY

POY eine phylogenetische Analyse-Programm, die mehrere Arten von Daten (Morphologie, Nukleotide, Genen und Genregionen, Chromosomen, und ganzer Genome) unterstützt. POY ist insbesondere dadurch gekennzeichnet, dass es wahr, Ausrichtung und Phylogenie Inferenz durchführen kann, dh Eingangssequenzen müssen nicht vorausgerichtet werden. Insertionen, Deletionen und Neuanordnungen kann dann in der Gesamtstruktur-Score unter maximale Parsimony oder im Modell unter Maximum Likelihood enthalten sein. Eine Vielzahl von heuristischen Algorithmen wurden für diesen Zweck entwickelt worden und werden in POY implementiert.