SEEDS

SEEDS ist die ökologische und evolutionäre Stochastic Dynamics-System.
Expanded Dokumentation:
Die primäre Quelle für die Dokumentation ist der Samen Website. Hier eine detaillierte Montageanleitung, schrittweise Anleitungen, Code-Vorlagen, und beispielsweise Experimente werden zur Verfügung gestellt.
Installieren SEEDS:
SEEDS erfordert die NetworkX Paket, verfügbar unter http://networkx.lanl.gov/. Zusätzlich SEEDS erfordert Python-Version 2.6.5 oder höher.
Samen können mit dem mitgelieferten setup.py-Skript, indem Sie "python setup.py install" installiert werden.
Wenn Sie das Verzeichnis, in das SEEDS installiert wurde, angegeben wird, werden Sie brauchen, um sicherzustellen, dass sie durchsucht werden in Ihrer Python-Umgebung ist. Dies kann durch das Verzeichnis, in dem es in Ihrem PYTHONPATH installiert wurde, durchgeführt werden.
Ausführen SEEDS:
Out of the box, umfasst SEEDS einfache Experimente im Beispielverzeichnis. Diese Versuche können ausgeführt werden, sobald SEEDS auf Ihrem System installiert wurde. In der Datei Readme.txt in einem bestimmten Verzeichnis, über das Experiment, wie sie zu konfigurieren, und wie man sie durchführen zu lernen.
Der Ausbau SEEDS:
SEEDS ist als Plugin-basiertes Framework entwickelt. Das bedeutet, dass Sie erstellen und verwenden Sie Ihre eigenen Zelltypen, Topologien und Topologien und sofort verwenden diese ohne Modifikation des Basis SEEDS Rahmen.
Um Experimente, Modell Verhaltensweisen für Sie von Interesse, wird ein Zelltyp erstellt werden müssen erstellen. Weitere Informationen zu diesem Verfahren finden Sie auf der SEEDS Website. Zusätzlich können Probenzelltypen im Beispiele-Verzeichnis.
Sobald Sie Ihre zusätzliche Arten oder Maßnahmen erstellt haben, legen Sie sie in einem Verzeichnis namens "Plugins" und bearbeiten seeds.cfg, Anweisen der Versuch, sie zu benutzen. Für Zelltypen, ändern Sie den Wert des Parameters "Zelle" im Abschnitt "Experiment". Für Topologien, ändern Sie den Wert des Parameters "Topologie" im Abschnitt "Experiment". Bei Maßnahmen, um den Parameter "Aktionen" durch Kommata getrennte fügen Sie im Abschnitt "Experiment". Parameter, um Ihre Plugins können in der seeds.cfg Datei im Abschnitt Sie in Ihrem Code definieren festgelegt werden

Anforderungen .

• Python