ImageSurfer ist ein kostenloses 3D-Imaging-Programm für die Mikroskopie. Es erlaubt Forschern, zu visualisieren und zu analysieren, Multi-Channel-3D- und 4D (Zeitraffer) Bände. ImageSurfer bietet mehrere Bildwiederherstellungswerkzeuge einschließlich Dekonvolutionsalgorithmen (Wiener Filter, eingeschränkt iterative und Maximum-Likelihood) zu entfernen Unschärfe durch das Abbildungssystem eingeführt. Zur Visualisierung bietet ImageSurfer mehrere Volumen und Oberflächen-Rendering-Techniken. Die Software verfügt über eine innovative farbige isosurface Modus, der eine qualitative Anzeige der Übereinstimmung zwischen zwei Kanälen bietet.
Ein "Scheibe Dunst" ermöglicht dem Benutzer, die einen Querschnitt des Volumens in jeder Orientierung genommen zu untersuchen. Das aufgenommene Scheibe kann auch als herkömmliche 2D-Bild oder als 3D-Relief Darstellung, in der die Bildintensität wird als Höhe codiert dargestellt werden. Um weiter zu sondieren räumliche Überlappung zwischen Strukturen kann der Forscher Daten von einem anderen Kanal verwenden, um den 3D-Relief-Darstellung zu kolorieren. Zur Quantifizierung Signalintensitätswerte können dann im aufgenommenen Scheiben entlang einer benutzerdefinierten Spline abgetastet werden. Neben Schnappschüsse von 3D-Darstellungen und Erzeugen Filme, können 3D-Modelle auch als OBJ oder VRML (Virtual Reality Modeling Language) Dateien exportiert werden; VRML-Dateien können im Web-Browser mit einem kostenlosen Plug-in angezeigt werden. Beide Dateitypen können in gängige 3D-Rendering-Programme zur Weiterverarbeitung importiert werden und in Acrobat 3D, um Dokumente, die interaktiv mit Adobe Reader 8 betrachtet werden können erzeugen.
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