Kommandozeilen-Tool für den Vergleich von Komma getrennte Dateien mit relativen Unterschiede, die am ähnlichsten Konformationen zu bestimmen. Compsort vergleicht die Daten-Dateien mit relativen Differenz, berechnet einen Ähnlichkeitswert, sortiert die Werte in aufsteigender Reihenfolge (niedrigere Werte stellen größere Ähnlichkeit), spart X Anzahl der niedrige Werte.
Die vom Benutzer erstellten Daten-Dateien, müssen getrennte Textdateien Komma werden. Jede Datei stellt ein einzigartiges Molekül. Jede Zeile in einer Datei stellt eine einzigartige Konformation des Moleküls. Die erste Spalte in der Datendatei ein Etikett einzigartig für die Konformation von der Zeile dargestellt werden. Der Rest der Spalten numerische Deskriptoren, wie Entfernung Raummessungen.
Die Reihen sind kombi zwischen Dateien verglichen. Die Etiketten im Vergleich verkettet und mit den Noten für die Gruppe von Zeilen gespeichert. Dies bietet eine Möglichkeit, die Konformation, die eine gegebene Ähnlichkeitsbewertung hergestellt identifizieren.
Zukünftige Arbeiten umfasst:
- Hinzufügen von GUI-Schnittstelle
- Entsendung Papier auf meinem 3D Pharmakophor Modellierungsalgorithmus
- Eine parallele Ausführung mit MPI
Was ist neu in dieser Pressemitteilung:
- Fest ein paar kleinere Compiler-Warnungen
- Added Reporting Berechnungszeit für Satz von kombinatorischen Berechnungen zusätzlich zu den zuvor berichteten Sortierzeit
- erhöht Compiler-Optimierung Ebene des binären
Anforderungen :
Mac OS X 10.3
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