Gabedit

Gabedit ist eine grafische Benutzerschnittstelle zu Gaussian, Molcas, Molpro und MPQC Computerchemie-Pakete.
 
 Gabedit enthält grafische Einrichtungen zur Erzeugung Schlüsselwörter und Optionen Molekül Spezifikationen und ther Eingangsabschnitten selbst für die modernsten Berechnungsarten Gabedit beinhaltet eine erweiterte Molecule Builder.
 
 Sie können es verwenden, um schnell in Moleküle in drei Dimensionen zeichnen und untersuchen sie. Sie können Moleküle durch Atom, Ring, Gruppe, Aminosäuren und Nucleosid zu bauen. Sie können auch Geometrie aus einer Datei gelesen. Die meisten großen molekularen Dateiformate werden unterstützt.
 
 Gabedit enthält eine Gaussian, Molcas, Molpro und MPQC Berechnung Setup-Fenster, das Sie Gaussian, Molcas, Molpro und MPQC Jobs auf einfache und unkomplizierte Weise einrichten können.
 
 Gabedit enthält einen Text-Editor zur Bearbeitung Molcas, Molpro, Gaussian und MPQC Eingabedateien.
 
 Gabedit können grafisch dargestellt werden eine Vielzahl von Gaussian, Molcas, Molpro, MPQC und (teilweise) ADF Berechnungsergebnisse, einschließlich der folgenden:
 
 ย ท Molekülorbitale.
 ย ท Oberflächen aus der Elektronendichte, elektrostatisches Potential, NMR Abschirmung Dichte und anderen Eigenschaften.
 ย ท Oberflächen können in fester, lichtdurchlässig und Drahtgitter-Modus angezeigt werden.
 ย ท Oberflächen können durch ein separates Objekt eingefärbt werden.
 ย ท Contours (farbcodiert).
 ย ท Planes (farbkodierten).
 ย ท Dipole
 ย ท XYZ-Achsen und die Hauptachsen des Moleküls.
 ย ท Animation der Normalmoden entsprechend Schwingungsfrequenzen.
 ย ท Animation der Drehung der Geometrie, Oberflächen, Dipol-, xyz und die Hauptachsen der Moleküle.
 ย ท Animation der Konturen.
 ย ท Animation der farbcodierte Ebenen.
 
 Gabedit anzeigen kann IR- und Raman-Spektren berechnet. Gabedit eine povray Datei für Geometrie (Atome + Anleihen, einschließlich Wasserstoffbindung ist), Flächen (einschließlich Flächen farbcodiert), Konturen, farbcodierte Ebenen zu erzeugen.
 
 Gabedit kann Bild in PPM, BMP, (JPEG) und PS-Format speichern. Gabedit automatisch eine Serie von Bildern für die Animation (Vibration, Geometrie Konvergenz, Drehung, Konturen, farbcodierte Ebenen) zu erzeugen

Was ist neu in dieser Pressemitteilung:

• Kleinere Fehler wurden behoben.
• NWChem wird jetzt unterstützt.
• Die native Windows-Spiele wird nun unterstützt.

Was ist neu in Version 2.3.5:.

• Minor Bugs wurden gefixt
• Atome können während eines Molekulardynamiksimulation festgelegt werden.
• Migration von Kairo nach OpenGL zum Zeichnen der Geometrie-Fenster.
• Migration von gtkglarea zu gtkglext.
• Parallelisierung mit OpenMP.

Was ist neu in Version 2.3.0:.

• Minor Bugs wurden gefixt
• Der Benutzer kann die Orbitale, Geometrie und Normalmoden von einer fchk Gaussian-Datei zu lesen.
• Man kann die Orbitale von der neuen MOPAC aux-Datei-Format (einschließlich der komprimierten Format) zu lesen.
• Einige neue Optionen in XYPlot und ContoursPlot Fenster (Text einfügen, Linie, Pfeil, Bilder, neue Themen ...).
• Die Bindungslängen während einer MD-Simulation festgelegt werden.
• Teiloptimierung ist nun möglich mit dem MM Potenzial.
• Implementierung eines Werkzeugs, um die Massen und Häufigkeiten der Isotope für einen bestimmten Moleküls vorherzusagen. Implementation eines Werkzeugs, um die elektrophile, nucleophile und radikale Anfälligkeiten für ein Molekül zu berechnen.

Was ist neu in Version 2.2.0:

• Minor Bugs wurden gefixt
• Alle geometrischen Veränderungen rückgängig gemacht werden kann und erneuert mit der Undo und Redo (u / U oder Strg-z / Ctrl y)
• Der Benutzer hat die vollständige Kontrolle über die in einer Zeichnung dargestellt Anleihen.
• Die Zeichnung des Moleküls atomweise vereinfacht.
• Die Zeichnung des Molekülfragment von Fragment wurden vereinfacht.
• Gabedit lesen Konnektivitäten von Gabedit, hin, PDB, mol2 und mol-Dateien.
• Der Benutzer kann den Wert der Entfernung, Bindungswinkel und Diederwinkel eingestellt.
• ein Molekulardynamik Konformationssuche wird mit einem MM Potential umgesetzt (Bernstein 99).
• Ein Molekulardynamik Konformationssuche wird mit einem Semi-empirische Methode (vom Open Mopac oder PCGamess) umgesetzt werden.
• Migration von GDK Zeichenfunktionen nach Kairo:. Geräteübergreifende Rendering für Vector Graphics
• Kairo ist nun für die XYplot Gabedit Widget (von Gabedit für Unentschieden Spektren verwendet wird) verwendet.
• Kairo ist nun für die Geometrie Zeichenfenster verwendet wird.
• Geometrie kann in eps, ps, pdf oder SVG-Datei exportiert werden.
• Die Kurven der XYplot Fenster kann in eps, ps, pdf oder SVG-Datei exportiert werden.
• Neues Tool für rechen Abstand zwischen 2 Punkten auf XYPlot Fenster. & Quot; Strg + Shift-Taste & quot; können Sie ein Zoom auf XYPlot Fenster verwendet werden.
• Die neue Version von PCGamess (Glühwürmchen) wird nun unterstützt

Was ist neu in Version 2.1.13:

• Kleinere Fehler wurden fixe
• ein Molekulardynamik Konformationssuche wird mit einem MM Potential umgesetzt (Bernstein 99).
• Ein Molekulardynamik Konformationssuche wird mit einem halbempirischen Potenzial (mit MOPAC oder PCGAMESS) umgesetzt werden.
• Man kann die Geometrie Optimierung interaktiv mit MOPAC oder PCGamess semi-empirischen Methode, von der Draw Geometriefenster
• Migration von GDK Zeichenfunktionen nach Kairo: Geräteübergreifende Rendering für Vektorgrafik. Kairo ist nun für die XYplot Gabedit Widget (von Gabedit für Unentschieden Spektren verwendet wird) verwendet. Kairo ist nun für die Geometrie Zeichenfenster verwendet wird.
• Geometrie kann in eps, ps, pdf oder SVG-Datei exportiert werden. Die Kurven der XYplot Fenster kann in eps, ps, pdf oder SVG-Datei exportiert werden.
• Neues Tool für rechen Abstand zwischen 2 Punkten auf XYPlot Fenster. & Quot; Strg + linke Maustaste & quot; können Sie ein Zoom auf XYPlot Fenster verwendet werden.
• Die neue Version des PC Gamess / Firefly wird jetzt unterstützt

Anforderungen :

• gtk +