Ghemical ist ein Computerchemie Software unter der GNU GPL veröffentlicht. Es bedeutet, dass vollständigen Quellcode des Pakets verfügbar ist, und die Benutzer sind frei, zu studieren und das Paket zu ändern. Ghemical ist in C ++ geschrieben.
Ghemical Projekt hat eine grafische Benutzeroberfläche (die auf GNOME basiert), und es beide Quantenmechanik (semi-empirischen und ab initio) Modelle und Molekülmechanik-Modellen unterstützt (es ist eine experimentelle Tripos 5.2 artigen Kraftfeld für organische Moleku auch ein Werkzeug für die reduzierte Protein-Modelle [1] enthalten ist. Geometrieoptimierung, Moleküldynamik und eine große Anzahl von Visualisierungswerkzeuge sind derzeit erhältlich.
Ghemical beruht auf externen Code, um die quantenmechanischen Berechnungen liefern. Semi-empirischen Methoden MNDO, MINDO / 3, AM1 und PM3 kommen aus dem MOPAC7 Paket (Public Domain) und werden in der Source-Distribution enthalten.
Die MPQC Paket (GNU GPL) wird verwendet, um ab initio Methoden bieten: die Methoden, die auf Hartree-Fock-Theorie sind derzeit mit Basissätze von STO-3G auf 6-31G ** unterstützt.
Die MPQC Code nicht in der Source-Distribution enthalten. Um die MPQC Basis ab initio Methoden in Ghemical verwenden, müssen Sie zuerst kompilieren und installieren Sie das Programm MPQC für Ihr System, und kompilieren Ghemical mit einige spezielle Einstellungen, die die Programme miteinander zu verknüpfen; finden Sie in der Datei INSTALL für weitere Informationen. Ghemical enthält auch die Openbabel Paket für Import und Export von Dateien in verschiedenen Formaten (wie auch andere Aufgaben).
Installation
Sobald Sie die neueste Version heruntergeladen haben, sollten Sie alle Dateien aus dem Archiv-Datei zu extrahieren mit "tar -zxvvf ghemical-1.00.tgz" oder gleichwertig "gunzip ghemical-1.00.tgz; tar -xvvf ghemical-1.00.tar". Danach lesen Sie bitte die Schaltfläche "Installieren" -Datei einfach extrahiert werden, um zusätzliche Informationen zu erhalten.
Was ist neu in dieser Version:
Kommentare nicht gefunden