MacMolPlt

MacMolPlt ist ein Chemie Visualisierungs-Tool, das verwendet werden kann, um Moleküle mit einer integrierten grafischen Modellbauer für die GAMESS Computerchemie-Programm zu bauen, erstellen Eingabedateien und dann visualisieren die Ergebnisse der Computerchemie läuft. Zur Ausstattung gehören eine qualitativ hochwertige 3D-Darstellung, Animationen von Normalmoden und Reaktionssequenzen und an einer Vielzahl von Formaten, einschließlich qualitativ hochwertige Bilder und Quicktime und Flash-Filme.

• Geben Sie mit:
• MolPlt Dateiformat GAMESS
• gestanzt durch Einfügen in kartesischen Koordinaten von jedem GAMESS oder Gauß- Log-Datei
• jede GAMESS Eingang, dich einzuloggen oder irc-Datei
• XMol Stil XYZ-Datei
• Molden-Dateien
• Protein Data Bank (PDB Datei)
• Chemical Markup Language (CML) Dateien
• Erstellen Sie grafisch mit einer interaktiven Molekül-Editor
• Erstellen von Hand mit kartesischen oder Z-Matrix-Stil internen Koordinaten
• 3D-Darstellung der Struktur und der Normal-Modus
• Animation der Normalschwingungen.
• 3D-Echtzeit-Rotation und Translation unter Maussteuerung
• Die Berechnung eines Z-Matrix-Parameter
• Optisch Maßnahme / Anzeige Abstände, Winkel und Flächenwinkel.
• Automatische Erstellung von Linear Least Motion (LLM) Wege
• 2D- und 3D-Berechnung und Anzeige von:
• Molekülorbitale (AOs, MOs oder LMO ist)
• Gesamtelektronendichte
• Dichteunterschiede
• Molekulare elektrostatische Potentiale (MEPMaps)
• Grundeingabedatei-Generator für GAMESS
• OpenGL für hochwertige 3D-Rendering verwendet
• Unterstützung für die Molekülsymmetrie
• Gene Symmetrie abhängig Atome
• Sie fest, Symmetrie einzigartige Atome
• die Liste der unterstützten Punktgruppen automatisch bestimmen für einen Satz von Koordinaten.
• koordiniert Drehen in die richtige Prinzip Orientierung
• Anzeige Symmetrieoperatoren für viele Punktgruppen
• Publicadruckqualität (Farbe oder Schwarz-Weiß) über Direktdruck oder kopieren und in eine andere Anwendung einfügen.
• Ausgabe in einer Vielzahl von Formen, einschließlich Windows-Bitmap, JPEG, PNG, CML, XMol XYZ, MDL MolFile, POV-Ray, Flash-Filme und Quicktime-Filme.

Was ist neu in dieser Pressemitteilung:

Einige Verbesserungen wurden an der Anzeige-Code gemacht. Optionen wurden für weiche Schattierungen mit und ohne Schatten auf die 3D-Fensterbereich der prefernces aufgenommen.
Hinzugefügt rudimentäre Unterstützung für Mopac Dateien.
Option hinzugefügt, um die Sichtbarkeit von ab initio, MM und EFP-Atome um.
Verbesserte Unterstützung für Core-Modell Potenziale.
Hinzugefügt einen Haken in das Eingabebauer für das neue GAMESSQ Programm.
Verbessert die PDB-Datei-Parser.