PathVisio

PathVisio ist ein Open Source und völlig kostenlos grafische Anwendung in der Programmiersprache Java von Grund auf für die Anzeige, Analyse und Bearbeitung von biologischen Wege unter einer GNU / Linux Betriebs verwendet werden konzipiert und realisiert system.Can verwendet werden, um Pfade zu zeichnen , link biologischen entitiesThe Software ermöglicht es Benutzern, Wege ziehen, link biologischen Einheiten (Proteine ​​oder Gene) biologische Daten mit Datenbankkennungen, bearbeiten Wegen sowie auf Wege analysieren. Mit PathVisio finden Sie auch in der Lage, experimentellen Daten, wie Microarray-Daten abzubilden, und visualisieren Sie es auf dem bestehenden Weg Zeichnung sein.
Darüber hinaus werden Sie in der Lage, ein Gen-Datenbank auswählen, wählen Sie eine Stoffwechsel Datenbank anzuzeigen Statistiken, Import Expressionsdaten, wählen Sie Ausdruck Datensatz, Suchwege, Blick Legende manipulieren Objekte, Import-Projekte sowie die Installation und Plugins verwalten, was können zusätzliche Funktionalität für die app.Requires keine Montageder Anwendung kann ohne Installation auf Ihrem GNU / Linux-Betriebssystem verwendet werden, hinzuzufügen. Alles, was Sie tun müssen, ist, um die Binär-Paket aus Softoware herunterladen, speichern Sie das Archiv auf einem Ort Ihrer Wahl, entpacken Sie es mit einem Archiv-Manager-Dienstprogramm, öffnen Sie das entpackte Verzeichnis und doppelklicken Sie auf das pathvisio.jar file.Under der hoodWhile bei einem kurzen Blick unter die Motorhaube des PathVisio Software, wir und rsquo; ve bemerkt, dass der Antrag vollständig in der Programmiersprache Java geschrieben sind, und dass die grafische Benutzerschnittstelle ist mit den neuesten Java-Swing-Technologien. Wir & rsquo; ve die Anwendung auf Computern unterstützt eine der 32 oder 64-Bit-CPU architectures.Runs auf jedem Betriebssystem, wo Java supportedBeing in der Programmiersprache Java geschrieben erfolgreich getestet, kann PathVisio eine plattformunabhängige Anwendung, die GNU / Linux unterstützt deklariert werden , Microsoft Windows, Mac OS X, BSD, Solaris und andere Betriebssystem, wo die neuesten Java-Technologien werden unterstützt

Was ist neu in dieser Pressemitteilung:.

• 31. Januar 2014: Bugfix Release
• GeneOntology Begriffe werden nun von Suchergebnissen entfernt für Anmerkungen
• Datanodes müssen mit ID und Datenquelle oder gar nichts mit Anmerkungen versehen werden (das Speichern von Daten Knoten mit nur ID oder Datenquelle wird nicht mehr erlaubt)

Was ist neu in Version 3.1.2:

• Wichtige Fehler in Datei-Import-Modul fest: http: //developers.pathvisio.org/ticket/1697

Was ist neu in Version 2.0.11:

• Autosave
• Zoom mit Scroll-Rad
• Die Auswahl der Linien ist einfacher: nicht mehr notwendig, von der genauen Pixel klicken
• Jetzt mit zwei Methoden für die Überrepräsentation Analyse; ein Weg orientiert und einem datenorientierten

Was ist neu in Version 2.0.10:

• Neue Möglichkeit, Zeichnung abgerundete Rechtecke zu vermeiden Dehnungseffekt
• Diverse kleinere Bugfixes

Was ist neu in Version 2.0.9:

• Neuer Anschlusstyp für den Anschluss beliebiger Länge und beliebiger Winkel
• New & quot; zellulären Komponente & rdquo; Immobilien zum Speichern der biologischen Bedeutung von einem Fach
• New & quot; Doppel & quot; Linientyp (besonders nützlich für Doppelmembran umschlossenes Organellen)
• anklickbare Hyperlinks im Wege
• siehe Meilenstein: & quot; milestone_27 & quot; Für eine vollständige Liste der Bugfixes

Was ist neu in Version 2.0.8:

• Verbesserte Formen für zelluläre Komponenten
• Ein paar Usability-Verbesserungen wie Kopieren / Einfügen im Kontextmenü
• siehe Meilenstein: & quot; milestone_26 & quot; Für eine vollständige Liste der Bugfixes

Was ist neu in Version 2.0.7:

• Toolbar-Icons und neue Seitenwand zu erleichtern Pfeil Arten und Formen wählen (dank liubing)
• Pathway-Datenbanken als Datenquelle enthalten, so dass Sie Links von einer Pfad zu einem anderen
hinzufügen
• BioPAX Konverter wurde verbessert und produziert mehr gültig BioPAX Dokumente.
• neuen Anschlusstyp, wo einzelne Punkte manipuliert werden können (dank leonth)
• Anzahl der Datenquellen auf über 180
erhöht
• siehe Meilenstein: & quot; milestone_25 & quot; Für eine vollständige Liste der Bugfixes

Was ist neu in Version 2.0.6:

• Die Anzahl der Anker auf einer Form erhöht werden aus der Standard-12.
• Eine Legende der Visualisierung von Daten können nun auf dem Weg Bild selbst angezeigt. Bisher war es nur in einer Seitenwand sichtbar.
• siehe Meilenstein: & quot; milestone_24 & quot; Für eine vollständige Liste der Bugfixes

Was ist neu in Version 2.0.4:

• verbesserte Textformatierung von Formen, Etiketten und Datanodes
• viele weitere Formen für Datanodes
• einfache Pixel-Koordinaten
• setzen Hintergrundfarbe auf Datanodes

Was ist neu in Version 2.0.3:

• Am bemerkenswertesten in dieser Version ist die neue XML-Schema für die GPML Weg Format (Version 2010a). Dieser neue Weg-Format ermöglicht es vielen neuen grafischen Möglichkeiten, die Zukunft, freuen Sie sich auf einige von denen in der nächsten Version erscheinen, freuen.
• Weitere neue Features:
• Invisible Anker wirklich unsichtbar, zumindest, wenn etwas mit ihnen verbunden sind (Danke an Margot)
• Zusätzliche Zeilenoption -v (Dank an Mark)
• Aktuell ausgewählte Datenbank richtig in der Statusleiste angezeigt wieder
• Viele neue Erweiterungspunkte für Plugin-Entwickler
• siehe Meilenstein: & quot; milestone_21 & quot; Für eine vollständige Liste der Bugfixes

Was ist neu in Version 2.0.1:

• Verbesserte Algorithmus zur automatischen Anschlüsse, die an einem Ankerpunkt .
• Verbesserte Zeichnung der Pfeil-Typen, die eine kurze & quot haben; Lücke & quot; am Ende.
• Da das thawte Freemail-Dienst abgebrochen wurde, haben wir unsere Sicherheitszertifikat
• Die Pathway Geschichte Zuschauer hatten einen Fehler, bei dem jede Zeile wurde als geändert, auch wenn es nicht war.
Dies wurde behoben.

Anforderungen :

• Oracle Java Standard Edition Runtime Environment