MacVector

        MacVector ist eine umfassende Macintosh-Anwendung, die Sequenzbearbeitung, Primerdesign, Internet-Datenbanksuche, Proteinanalyse, Sequenzbestätigung, multiple Sequenzausrichtung, phylogenetische Rekonstruktion, Analyse der Kodierungsregion und eine Vielzahl anderer Funktionen bietet. MacVector wird allgemein als das intuitivste und leicht zu verwendende Programm für die Sequenzanalyse angesehen.
    

Was ist neu in dieser Version:

Einige kleinere Probleme mit Align To Reference, wenn Reads ausgerichtet ab dem letzten Rest von zirkulären Sequenzen wurde behoben.

Was ist neu in Version 16.0.6:

Einige kleinere Probleme mit "Ausrichten auf Referenz" wurden behoben, als Lesevorgänge ab dem letzten Rest von zirkulären Sequenzen ausgerichtet wurden.

Was ist neu in Version 16.0.2:

Ein Absturz beim Aufrufen der Funktion "Ausrichten auf Reference Add Seqs" auf OS X 10.7 und OS X 10.8 wurde behoben .

Wenn Sie eine Sequenz im GenBank-Format exportieren, schreibt MacVector jetzt alle GenBank-Funktionen aus, auch wenn sie gerade veraltet sind.

Was ist neu in Version 15.5.4:

Die Double-Digest-Ausgabe von Restriction Enzyme funktioniert jetzt wie erwartet, wenn nur zwei oder drei Enzyme ausgewählt werden.

Was ist neu in Version 15.1.4:

Die 3/6-Frame-Übersetzung im Single-Sequence-Editor behält nun den Frame korrekt bei
nach einem Zeilenumbruch.

Ein Absturz beim Einschalten der 3/6-Frame-Übersetzung im Align To Reference Editor mit einem
Sequenzen, die größer als 65.000 Reste sind, wurden behoben.

Was ist neu in Version 15.1.3:

Ein Fehler im Editor für mehrere Sequenz-Alignments wurde behoben . Die Auswirkung dieses Fehlers war, dass zu Beginn der Sequenzen manchmal zusätzliche Reste auftauchten, als sie gespeichert wurden. Dies betrifft nur MSA-Dokumente, die bearbeitet wurden. Wenn Sie nur mit ClustalW / Muscle / T-Coffee ausgerichtet und ohne Bearbeitung gespeichert haben, sind die Alignments korrekt.

Was ist neu in Version 15.1.1:

Stürzt beim Speichern bestimmter bearbeiteter Multiple Sequence Alignment ab
(.msan, .msap) Dokumente wurden aufgelöst.

Ein Fehler, bei dem einige Fastq-Lesevorgänge mehrfach aus den Ergebnissen einer Align To Folder-Suche ausgeschrieben wurden, wurde behoben.

Was ist neu in Version 14.5.3:

Ein gelegentlicher Absturz in der Funktion "An Ordner ausrichten" wurde behoben.

Ein seltener Absturz beim Testen von Primerpaaren wurde behoben

Was ist neu in Version 14.5.2:

An Ordner ausrichten wird jetzt korrekt mit a behandelt Segment einer Sequenz, die den kreisförmigen Ursprung kreuzt.

Wenn Sie in den Karteneinstellungen die Option "Automatic RE Searching" aktivieren / deaktivieren, werden nun alle geöffneten Fenster korrekt aktualisiert.

Was ist neu in Version 14.0:

Zusammen mit der Leistungssteigerung bei der Arbeit mit großen Sequenzen und Alignments gibt es bedeutende Verbesserungen bei der Behandlung von Primern (einschließlich der Unterstützung von Primer-Datenbanken) und NGS-Daten.

Was ist neu in Version 13.5.5:

Ein Problem mit Features vom Typ "????" würde beim Öffnen einer gespeicherten Align To Reference (.axml) -Datei erstellt werden.

Was ist neu in Version 13.5.3:

• Die Anzeige des Contig-Editors wird nun beim Laden einer gespeicherten Ausrichtung unter OS X 10.6 korrekt aktualisiert.
• Ein Absturz wurde in der Proteinanalyse-Toolbox behoben.
• Ein Absturz in der Quicktest-Primer-Schnittstelle beim Arbeiten mit einer großen Anzahl von Restriktionsenzymen wurde behoben.

Was ist neu in Version 13.5.2:

Ein Bildlaufproblem im Contig Editor / Align to Reference Editor wurde behoben. Ein seltener Absturz beim Aufwachen in einem anderen Netzwerk wurde behoben.

Was ist neu in Version 13.5.1:

• Unter OS X 10.6 behalten importierte Sequenzen jetzt ihren ursprünglichen Dateinamen.
• Ein gelegentlicher Absturz beim Schließen von modifizierten Sequenzen, die nicht gespeichert wurden, wurde behoben.
• Übersetzungen in der kommentierten Textausgabe werden jetzt korrekt den Präferenzflags gerecht.
• Einige Unstimmigkeiten bei der Nummerierung von "unbenannten" Sequenzen wurden behoben.
• Ein Problem, bei dem Sequenzfenster unter OS X 10.6 verschwinden würden, wurde gelöst,
• Eine Anzahl von Anzeigefehlern im Editor "An Referenz ausrichten" wurde behoben.
• Ein Problem, bei dem auf der Registerkarte "Map" manchmal keine Übersetzungen vorhanden waren, wenn auf den Rückstandswert gezoomt wurde, wurde behoben.
• Die Möglichkeit, BAM-Dateien in ein Assembler-Projekt zu importieren, wurde wiederhergestellt.
• Nucleic acid multiple alignment documents haben jetzt ihre eigenen Farbgruppen und Blockierungsstandards.
• Primer im "Test PCR Primer Pair" -Modus des Primer-Designs können nun über 35 nt lang sein.
• Textansichten werden jetzt automatisch in der Breite angepasst, um auf einer einzelnen Seite zu drucken.

Was ist neu in Version 13.5:

Die Grafik Symboleditor und die schwebende Grafikpalette wurden in Vorbereitung für den Wechsel von MacVector zu einer 64-Bit-Architektur (fällig mit MacVector 14.0) neu geschrieben. Die anderen Haupterweiterungen zielen auf eine bessere Handhabung von Next Generation Sequencing (NGS) -Dateien ab, insbesondere mit den Funktionen Align To Folder und Assembler Velvet de novo Assembly. Es gab auch eine Code-Optimierung, um die Analyse von großen genomischen Sequenzen besser zu handhaben, besonders bemerkenswert mit der Pustell Matrix "Dot-Plot" -Funktionalität.