GENESIS (kurz für allgemeine NEural Simulationssystem) ist ein Allzweck-Simulationsplattform, die entwickelt wurde, um die Simulation neuronaler Systeme, die von subzellulären Komponenten und biochemische Reaktionen zu komplexen Modellen einzelner Neurone, Simulationen von großen Netzwerken und Systeme- unterstützen Level-Modelle.
GENESIS hat die Basis für Praktika in neuronalen Simulation am Caltech, dem Marine Biological Laboratory, der Crete, Trieste, Bangalore, und Obidos kurze Kurse in Computational Neuroscience vorgesehen ist, und mindestens 49 Hochschulen, die uns bekannt sind.
Die meisten aktuellen GENESIS Anwendungen beinhalten realistische Simulationen von biologischen neuronalen Systemen. Obwohl die Software auch abstraktere Netze modellieren, sind andere Simulatoren geeigneter für Backpropagation und ähnliche connectionist Modellierung.
Installation
1. Wählen Sie den Ort, an dem Sie die "genesis" Verzeichnisbaum installieren möchten. Wenn Sie so eine systemweite Installation als Benutzer "root" sind, / usr / local ist eine gute Wahl. Für eine persönliche Installation ohne Root-Rechte, können Sie Ihr Home-Verzeichnis ("~") zu verwenden. Wechseln Sie in dieses Verzeichnis, und extrahieren Sie die Genesis-Verzeichnis aus der Archivdatei genesis2.2.1-linux-bin.tar.gz. Zum Beispiel,
cd / usr / local
tar xvzf /mnt/cdrom/genesis2.2.1-linux-bin.tar.gz
oder von wo Sie es (zB ~ / downloads / genesis2.2.1-linux-bin.tar.gz) haben.
2. Wechseln Sie in das Verzeichnis "genesis" und starten Sie das Setup-Skript, das die ".simrc" GENESIS Initialisierungsdatei "erstellt. Kopieren Sie dann .simrc zu Ihrem Home-Verzeichnis.
cd genesis
./binsetup
cp .simrc ~
3. SCHLIESSLICH, fügen Sie die Genese Verzeichnis zu Ihrem Suchpfad, so dass "genesis" kann von jedem Verzeichnis, das Sie in sich zu finden. Wenn Sie Ihre Login-Shell bash ist, können Sie dies tun, indem Sie die Datei .bashrc in Ihrem Home-Verzeichnis die Zeile hinzufügen
PATH = $ PATH: / usr / local / genesis
am Ende der Datei. Wenn Sie tcsh oder csh als Shell-Befehl, fügen Sie
set path = ($ path / usr / local / genesis)
um Ihre .tcsh oder .csh Datei.
An diesem Punkt sind Sie bereit, versuchen Sie GENESIS. Wechseln Sie in das Verzeichnis genesis / Scripts und versuchen, einige der Übungen in der Readme-Datei empfohlen
Was ist neu in dieser Pressemitteilung:.
- Zahlreiche Bugfixes und Verbesserungen.
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