CLC Sequence Viewer

Screenshot der Software:
CLC Sequence Viewer
Softwarebeschreibung:
Version: 7.7.1 Aktualisiert
Upload-Datum: 1 Oct 16
Entwickler: CLC bio
Lizenz: Frei
Popularität: 288
Größe: 71872 Kb

Rating: nan/5 (Total Votes: 0)

CLC Sequence Viewer erzeugt eine Softwareumgebung, Benutzern ermöglicht, eine große Anzahl von bioinformaticsanalysen, kombiniert mit glatten Datenmanagement und eine exzellente grafische Anzeige und Ausgabeoptionen.

Was ist neu in diesem Mitteilung:

Neue Funktionen und Verbesserungen

  • Die gesamte Kommunikation NCBI-Server ist jetzt verschlüsselt. (NCBI werden alle Web-Services auf das HTTPS-Protokoll am 30. September Jahr 2016 zu bewegen). & Nbsp;

  • Die Liste der Enzyme in der Werkbank vorinstalliert & nbsp; wurde aktualisiert, von rEBASE.

  • die Schnellstartwerkzeug jetzt unter der Toolbox-Menü anstelle des Menüs Ansicht und eine Schaltfläche namens starten, die dieses Tool bringt wurde der Symbolleiste hinzugefügt.

  • Die Option "ist nicht in der Liste" als neue Tabellenfilteroption eingeführt wurde.
  • Die "Sort Ordner" Tool nun numerische Sortierung nach Dateinamen verwendet Präfix mit einer Nummer.

  • Neue Platzhalter sind verfügbar, wenn die Namen der Exporteur Ausgänge definieren: & nbsp; {User}, & nbsp; {host}, und für Elemente der Zeitstempel des Ausgabeobjekt, {Jahr}, & nbsp; {Monat}, & nbsp; {Tag}, & nbsp; {Stunde, & nbsp; {minute}, & nbsp; . {zweite} & nbsp;
  • Platzhalter innerhalb Exportausgangsnamen, die bisher nur zur Verfügung standen als Ziffern können nun mit schriftlicher Namen angegeben werden: {input} ist ein Synonym für {1}, {extension} ist ein Synonym {2} für und {counter} ist ein Synonym für {3}.
  • GenBank Import erlaubt nun auch für Dateinamen mit 'GBFF' Erweiterung.

  • lesen Gruppendetails werden nun auf der Element-Info-Ansicht von Sequenzlisten.

Bug fixes
  • Es wurde ein seltenes Problem, wo einige Anmerkungen konnte gezeigt , aber nicht unbedingt haben, verloren gehen auf & nbsp; Sequenzen mit mehr als 1000 Anmerkungen eines bestimmten Typs auf dieser Sequenz vor dem Löschen und wo die Menüoption der rechten Maustaste im Kontext "Auswahl löschen" verwendet wurde. & nbsp;

  • Es wurde ein Fehler im Assistenten "Manage Enzyme", die einen Benutzer von Aufheben der Aktion verhindert, wenn "Speichern als neues Enzym Liste" wurde aktiviert.

  • Ein Problem mit dem Import von Metadaten Tool, wo, wenn eine Tabelle bereits geladen worden war, dann die gleiche Tabellen Auswahl wieder nicht den Tabelleninhalt neu geladen hat.

  • ein Problem wurde behoben, bei dem es eine lange Zeit dauerte eine Werkbank zu öffnen, es war es & nbsp; previouslyclosed wenn eine offene Tabelleneditor angezeigt werden, die sortiert worden war. & nbsp;

  • ein Problem wurde behoben, bei dem der rechten Maustaste auf ein Diagramm in einem Bericht und die Wahl zu zeigen, "Report", "Geschichte" oder "Element-Info" einen Fehler ausgelöst hat.

  • Verschiedene kleinere Fehlerbehebungen .

Was ist neu in der Version 7.7:

  • Alle Excel-Tabellen in einem Dokument jetzt importiert werden und jedes Blatt hat eine Tabelle, für deren Richtigkeit erstellt.
  • Die CSV, HTML und Excel-Tabelle / tabellarische Exporteur jetzt verwenden "Inf "und" NaN "Werte die zweideutige zu ersetzen"? ".
  • sie im Assistenten für eine Tabelle im CSV-Format zu exportieren, wenn nicht alle Spalten zu exportieren, ist es nun möglich, abzubrechen oder zum vorherigen zurück Schritt während ausgewählte Spalten geladen werden. & nbsp;
  • Same Druckeinstellungen nun für mehrere Berichte in einem einzigen Export angewendet werden kann. & nbsp;
  • Die "Ressourcen verwalten" Registerkarte entfernt wurde . die das Plugin-Manager

Was ist neu in Version 7.6.1:

Bug fixes

  • Ein Problem wurde behoben, wo einige Filteroperationen, wie zum Beispiel "nicht enthalten" nicht korrekt gehandelt haben kann, wenn Tabellenzellen Filtern, die mehrere Stücke von Informationen enthalten sind.
  • Feste ein Problem, bei dem Annotationen, die die Enden eines Kreis Sequenz überspannt würde falsch in der Kreissequenzansicht platziert werden.
  • ein Fehler wurde behoben, dass die Werkbank verursacht einzufrieren, wenn bestimmte Sequenzen in Kreisansicht mit radialer Rendering angezeigt wurden von Etiketten.
  • ein Problem behoben, bei dem einige Filteroperationen, wie zum Beispiel "nicht enthalten" nicht korrekt gehandelt haben kann, wenn Tabellenzellen filtern, die mehrere Stücke von Informationen enthalten sind.
  • ein Problem wurde behoben dass verhindert ein Stammordner auf Windows von Laufwerke als Dateipfad verwendet wird.
  • ein Fehler behoben, unter Windows eine vorhandene Installation zu aktualisieren in der .vmoptions Datei führen würde gelöscht werden, die die Workbench laufen mit der macht . Standard-Java-Konfiguration

Was ist neu in der Version 7.6:

Neue Funktionen und Verbesserungen

  • Ein 3D-Molekül-Viewer ist jetzt verfügbar für die Visualisierung von Proteinen, RNA, DNA und kleine Moleküle.
  • Verbesserte Berichterstattung von Fehlern zu geringen Speicherplatz verwandt.
Bug fixes
  • das Problem mit Links und Text in Tabellen, die abgeschnitten wurden, wenn ein Link nachfolgenden
  • Restriction Site-Analyse. Die Werte "cut Position (s) "Spalte der Restriktionsstelle Analysetabelle verhält sich nun wie Zahlen anstelle von Text, was bedeutet, das Sortieren und filtern funktioniert.
  • Ein Problem mit gespeicherten Tabelleneinstellungen, die manchmal nicht behoben wurde nicht funktioniert. Der Bug-Fix enthält eine robustere / generic Weise Tabelleneinstellungen mit unterschiedlichen Spalten zu speichern. Um dieses Problem zu beheben, vorhandene gespeicherte Tabelleneinstellungen sollten zunächst auf ein Objekt geladen werden, wo er arbeitet (das heißt die gleichen Spalten wie wenn es gespeichert wurde); und dann sollten die Tabelleneinstellungen mit dem alten Namen gespeichert werden, um die Einstellungen zu überschreiben & nbsp;

  • Metadaten für phylogenetische Bäume. Ein Fehler wurde behoben, & nbsp; mit dem Import von Metadaten Spalte Namen mit Doppelpunkte.

  • Fixed Fehler, wenn die Protein Übersetzungen von Annotationen zeigt kürzer als 3-Basen.

Was ist neu in der Version 7.5.

  • Die nicht verwendeten "Workflows" Schaltfläche in der Symbolleiste entfernt wurde
  • Lokale Suche in der Menüleiste aktiviert nun auch Filterung auf "Pfad".
  • Erweiterte Filterung auf Tabellen nun die Möglichkeit, für ein Leerzeichen, Komma oder Semikolon begrenzt Begriffslisten zu filtern enthält.
  • Zoom-Werkzeuge Redesign:. Die Zoom-Auswahlfunktion ist nun auch für Sequenzen, Sequenzlisten, Ausrichtungen und Zuordnungen lesen
  • Speichern / Anwenden Seitenbildeinstellungen für Tabellen arbeitet jetzt für verschiedene Tabellen, dass teilen einige Spalten. & nbsp;.
  • Kopieren Operationen jetzt gestoppt werden kann

  • importieren von Beispieldaten und die Importe durch ziehen von Dateien in die Werkbank getan und sie im Navigationsbereich fallen nicht mehr blockieren die Benutzeroberfläche während der Ausführung. Stattdessen geschieht der Import als Hintergrundprozess, der in der linken unteren Ecke über die Registerkarte Prozesse überwacht und gesteuert werden kann.

  • CLC Werkbänke jetzt hochauflösende Displays wie Apple unterstützen Displays aller Datennetzhaut im Blick Region (einschließlich Tooltips) gezeigt.
  • Weitere informative Benennung der kodierenden Region Übersetzungen erzeugt durch das Werkzeug an Protein übersetzen. Der Name für einen kodierenden Bereich Übersetzung besteht aus dem Namen der Eingabesequenz durch die Annotationstyp und schließlich die Anmerkung Namen.

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