STEPS ist ein Paket für die exakte stochastische Simulation von Reaktions-Diffusions-Systeme in beliebig komplexe 3D-Geometrien. Unsere Kernsimulationsalgorithmus ist eine Implementierung Gille SSA, verlängert, um mit der Diffusion von Molekülen über die...
NEO (Neurale Ensemble-Objekte) und ist ein Projekt, um einen gemeinsamen Satz von Basisklassen stellen in neuronalen Datenanalyse verwendet werden, mit dem Ziel, immer OpenElectrophy, NeuroTools und vielleicht anderen Projekten mit ähnlichen Zielen näher...
OpenElectrophy ist ein Rahmen zur Manipulation, Speicherung und Analyse der elektrophysiologischen Daten zu erleichtern. Es kann Daten aus vielen verschiedenen Dateiformaten importieren und speichern sie in einer einzigen...
Torf ist eine Sammlung von Programmen zur Erfassung, Vorhersage und Analyse der biophysikalischen Eigenschaften von Proteinen.Siehe http://enzyme.ucd.ie/PEAT für die Dokumentation, Anleitungen, Screenshots etc. Anforderungen . ...
Burrows-Wheeler Aligner (BWA) ist ein leistungsfähiges Programm, das verhältnismäßig kurze Nukleotidsequenzen gegen eine lange Referenzsequenz richtet wie das menschliche Genom.Die Software implementiert zwei Algorithmen, BWA-kurzen und BWA-SW. Die...
SSuMMo ist eine Bibliothek von Funktionen, um iterativ entwickelt, mit hmmer um Sequenzen zu Taxa zuzuordnen. & Nbsp; Die Ergebnisse sind sehr annotiert, die Art / Gattung Verteilung innerhalb dieser Gemeinschaft.Programme mit dem Quellcode enthalten sind...
Grundel ist ein Python-API zum Lesen von Binärdaten-Dateien mit dem Goby Next-Gen-Daten-Management-Framework erstellt.Normalerweise kommt dieses Verzeichnis als Teil des kompletten Goby-Paket, erhältlich von:& Nbsp; http: //goby.campagnelab.org/Das...
PySCeS ist ein Projekt von Triple-J Gruppe für Molekulare Zellphysiologie & nbsp entwickelt;., Um Modell zu versuchen und zu verstehen, die komplexen Prozesse und Systeme, die den lebenden Zelle Eigenschaften . Eine textbasierte...
Pysam ist ein Python-Modul zum Lesen und Bearbeiten von Samfiles. & Nbsp; Es ist ein leichtes Umhüllung der samtools C-API.Die Kurzanleitung finden Sie hier. Weitere ausführliche Dokumentation finden Sie hier.Fragen und Kommentare sind sehr willkommen und...
TRMiner ist ein Python-Programm, das auf wissenschaftlichen Daten Kuratoren soll. & Nbsp; Es ermöglicht, schnell zu beschneiden große Sammlungen von wissenschaftlichen Publikationen, um für eine bestimmte Bergbau Ziel entsprechenden Sätze.Dies wird in...
